Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTA1Q13424 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNTA1Q13424 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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