Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
MRPL49Q13405 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
MRPL49Q13405 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MRPL49Q13405 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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