Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
GRIN2BQ13224 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC38.19■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC38.17■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
GRIN2BQ13224 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
GRIN2BQ13224 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
GRIN2BQ13224 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
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