Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRDNQ13061 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRDNQ13061 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms