Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TP53BP1Q12888 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
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TP53BP1Q12888 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
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TP53BP1Q12888 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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TP53BP1Q12888 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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TP53BP1Q12888 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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TP53BP1Q12888 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TP53BP1Q12888 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TP53BP1Q12888 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TP53BP1Q12888 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TP53BP1Q12888 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TP53BP1Q12888 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TP53BP1Q12888 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TP53BP1Q12888 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TP53BP1Q12888 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TP53BP1Q12888 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TP53BP1Q12888 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TP53BP1Q12888 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TP53BP1Q12888 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TP53BP1Q12888 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TP53BP1Q12888 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TP53BP1Q12888 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TP53BP1Q12888 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TP53BP1Q12888 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TP53BP1Q12888 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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