Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TROQ12816 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
TROQ12816 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TROQ12816 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
TROQ12816 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
TROQ12816 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TROQ12816 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TROQ12816 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
TROQ12816 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TROQ12816 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TROQ12816 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TROQ12816 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TROQ12816 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TROQ12816 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TROQ12816 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
TROQ12816 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TROQ12816 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TROQ12816 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TROQ12816 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TROQ12816 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TROQ12816 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TROQ12816 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
TROQ12816 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TROQ12816 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TROQ12816 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TROQ12816 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TROQ12816 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TROQ12816 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TROQ12816 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
TROQ12816 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TROQ12816 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
TROQ12816 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
TROQ12816 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
TROQ12816 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
TROQ12816 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
TROQ12816 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TROQ12816 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
TROQ12816 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
TROQ12816 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TROQ12816 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TROQ12816 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TROQ12816 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TROQ12816 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TROQ12816 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
TROQ12816 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
TROQ12816 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TROQ12816 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TROQ12816 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TROQ12816 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TROQ12816 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TROQ12816 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TROQ12816 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TROQ12816 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TROQ12816 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TROQ12816 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
TROQ12816 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TROQ12816 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
TROQ12816 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
TROQ12816 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TROQ12816 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TROQ12816 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
TROQ12816 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TROQ12816 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TROQ12816 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
TROQ12816 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
TROQ12816 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
TROQ12816 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TROQ12816 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TROQ12816 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
TROQ12816 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TROQ12816 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TROQ12816 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TROQ12816 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TROQ12816 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TROQ12816 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
TROQ12816 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
TROQ12816 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
TROQ12816 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TROQ12816 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TROQ12816 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TROQ12816 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
TROQ12816 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TROQ12816 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TROQ12816 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
TROQ12816 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
TROQ12816 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
TROQ12816 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
TROQ12816 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TROQ12816 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TROQ12816 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
TROQ12816 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TROQ12816 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
TROQ12816 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TROQ12816 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TROQ12816 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TROQ12816 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TROQ12816 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
TROQ12816 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
TROQ12816 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.26
TROQ12816 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
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