Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFEMP1Q12805 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFEMP1Q12805 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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