Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LOXL1Q08397 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LOXL1Q08397 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms