Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNG1Q06432 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNG1Q06432 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms