Protein–RNA interactions for Protein: Q06410

ATG17, Autophagy-related protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG17Q06410 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 RPB4YJL140W 666 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 SLD7YOR060C 774 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 CTT1YGR088W 1689 nt4.72□□□□□ -1.65
ATG17Q06410 TIF4632YGL049C 2745 nt4.71□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 ASP1YDR321W 1146 nt4.71□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt4.71□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 PDR15YDR406W 4590 nt4.71□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 RFT1YBL020W 1725 nt4.71□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 YJR124CYJR124C 1347 nt4.71□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 GDE1YPL110C 3672 nt4.7□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 SNF11YDR073W 510 nt4.7□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 RDL1YOR285W 420 nt4.7□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 CBC2YPL178W 627 nt4.7□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 MRL1YPR079W 1146 nt4.7□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 ARR3YPR201W 1215 nt4.7□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 FAP1YNL023C 2898 nt4.7□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 ISR1YPR106W 1332 nt4.7□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 TPO2YGR138C 1845 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 GRC3YLL035W 1899 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 YDL124WYDL124W 939 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 CNL1YDR357C 369 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 ADK2YER170W 678 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 YGR153WYGR153W 654 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 YHR145CYHR145C 357 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 HPM1YIL110W 1134 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 YJL211CYJL211C 444 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 HFA1YMR207C 6372 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 GSP2YOR185C 663 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 ARC40YBR234C 1155 nt4.69□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 OLE1YGL055W 1533 nt4.68□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.68□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 RVB1YDR190C 1392 nt4.67□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 RIP1YEL024W 648 nt4.67□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 YHR095WYHR095W 495 nt4.67□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 NAT5YOR253W 531 nt4.67□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 ICE2YIL090W 1476 nt4.67□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 NUP2YLR335W 2163 nt4.67□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 YMR102CYMR102C 2505 nt4.67□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 EGT2YNL327W 3126 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 TGL4YKR089C 2733 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 MID2YLR332W 1131 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 GPI12YMR281W 915 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 SMA1YPL027W 738 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 CAR1YPL111W 1002 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 CBP3YPL215W 1008 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 OPY2YPR075C 1083 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 FDC1YDR539W 1512 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 ATG18YFR021W 1503 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 YMR196WYMR196W 3267 nt4.66□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 APJ1YNL077W 1587 nt4.65□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 GCR2YNL199C 1605 nt4.65□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 PCL8YPL219W 1479 nt4.65□□□□□ -1.66
ATG17Q06410 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.65□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 LST8YNL006W 912 nt4.65□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 YNL194CYNL194C 906 nt4.65□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 NHP6AYPR052C 282 nt4.65□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt4.65□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 APM4YOL062C 1476 nt4.64□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 CBP4YGR174C 513 nt4.64□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 YGR269WYGR269W 327 nt4.64□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 SHP1YBL058W 1272 nt4.64□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 UIP4YPL186C 915 nt4.64□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 HNT2YDR305C 654 nt4.63□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 GLE2YER107C 1098 nt4.63□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 ECM1YAL059W 639 nt4.63□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 TAF5YBR198C 2397 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 DPB2YPR175W 2070 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 KIN28YDL108W 921 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 SCM3YDL139C 672 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 HST4YDR191W 1113 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 SEH1YGL100W 1050 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 BNS1YGR230W 414 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 SWP1YMR149W 861 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 BUD17YNR027W 954 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 POP4YBR257W 840 nt4.62□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 PRT1YOR361C 2292 nt4.61□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 ACT1YFL039C 1128 nt4.61□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 MRPL22YNL177C 930 nt4.61□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 CSL4YNL232W 879 nt4.61□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 KIC1YHR102W 3243 nt4.61□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 MDM34YGL219C 1380 nt4.61□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 PRD1YCL057W 2139 nt4.61□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 EAR1YMR171C 1653 nt4.61□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 SSB1YDL229W 1842 nt4.6□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 SSB2YNL209W 1842 nt4.6□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.6□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.6□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.6□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 YFL068WYFL068W 483 nt4.6□□□□□ -1.67
ATG17Q06410 SUT1YGL162W 900 nt4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.8 ms