Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBE1Q04446 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBE1Q04446 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GBE1Q04446 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms