Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARID5AQ03989 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms