Protein–RNA interactions for Protein: Q03702

CCE1, Cruciform cutting endonuclease 1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCE1Q03702 YBR016WYBR016W 387 nt4.76□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 FEX1YOR390W 1128 nt4.76□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 YPL199CYPL199C 723 nt4.76□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 FEX2YPL279C 1128 nt4.76□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 CYK3YDL117W 2658 nt4.76□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 SPC97YHR172W 2472 nt4.75□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 HXT4YHR092C 1731 nt4.75□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 NUP1YOR098C 3231 nt4.75□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 ATH1YPR026W 3636 nt4.75□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 HST4YDR191W 1113 nt4.75□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 ECM15YBL001C 315 nt4.75□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 YPL071CYPL071C 471 nt4.75□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 BRE2YLR015W 1518 nt4.74□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 MCH4YOL119C 1506 nt4.74□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 IPK1YDR315C 846 nt4.74□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 MMS21YEL019C 804 nt4.74□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.74□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 MRPL25YGR076C 474 nt4.74□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 YOL035CYOL035C 303 nt4.74□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 PUT1YLR142W 1431 nt4.73□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 MUM3YOR298W 1440 nt4.73□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 NRD1YNL251C 1728 nt4.73□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 MHF2YDL160C-A 243 nt4.73□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 AAD4YDL243C 990 nt4.73□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 PAD1YDR538W 729 nt4.73□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 DBP8YHR169W 1296 nt4.73□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 ISY1YJR050W 708 nt4.73□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 MRPL39YML009C 213 nt4.73□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt4.73□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 RPC19YNL113W 429 nt4.73□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 YNL174WYNL174W 573 nt4.73□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 DCI1YOR180C 816 nt4.73□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 LAS21YJL062W 2493 nt4.73□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 MMT2YPL224C 1455 nt4.73□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 DOA1YKL213C 2148 nt4.73□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 BUD7YOR299W 2241 nt4.73□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 IMA1YGR287C 1770 nt4.73□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 ROT2YBR229C 2865 nt4.72□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 SPO12YHR152W 522 nt4.72□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 YMR245WYMR245W 621 nt4.72□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 MET31YPL038W 534 nt4.72□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 NHP6AYPR052C 282 nt4.72□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 SLT2YHR030C 1455 nt4.72□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 AFT1YGL071W 2073 nt4.72□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 SSY5YJL156C 2100 nt4.72□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 FRE3YOR381W 2136 nt4.72□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 BIT2YBR270C 1638 nt4.72□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 UBX7YBR273C 1311 nt4.72□□□□□ -1.65
CCE1Q03702 PRM1YNL279W 1986 nt4.71□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 SLC1YDL052C 912 nt4.71□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 PDE1YGL248W 1110 nt4.71□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 YKL107WYKL107W 930 nt4.71□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 PRS1YKL181W 1284 nt4.71□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 MDY2YOL111C 639 nt4.71□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 SNF3YDL194W 2655 nt4.71□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 STE20YHL007C 2820 nt4.71□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 SUM1YDR310C 3189 nt4.71□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 ARN2YHL047C 1863 nt4.71□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 RPT2YDL007W 1314 nt4.71□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 GCN20YFR009W 2259 nt4.7□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 SLD2YKL108W 1362 nt4.7□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 YDL027CYDL027C 1263 nt4.7□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 TRS23YDR246W 660 nt4.7□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 ASP1YDR321W 1146 nt4.7□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.7□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 ADD37YMR184W 597 nt4.7□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 FRE7YOL152W 1863 nt4.7□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 MCX1YBR227C 1563 nt4.7□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 KCH1YJR054W 1494 nt4.69□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 YAP1802YGR241C 1707 nt4.69□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 YMR102CYMR102C 2505 nt4.69□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 SCM3YDL139C 672 nt4.69□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 APS1YLR170C 471 nt4.69□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 OSW5YMR148W 447 nt4.69□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 AIR2YDL175C 1035 nt4.68□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 AAD6YFL056C 639 nt4.68□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 DBF2YGR092W 1719 nt4.68□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 OCA5YHL029C 2040 nt4.68□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 YHR182WYHR182W 2358 nt4.68□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 RRP3YHR065C 1506 nt4.67□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 HOF1YMR032W 2010 nt4.67□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 IMD3YLR432W 1572 nt4.67□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 YIF1YNL263C 945 nt4.67□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 TLG2YOL018C 1194 nt4.67□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 YPL191CYPL191C 1083 nt4.67□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 QCR2YPR191W 1107 nt4.67□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 HIR2YOR038C 2628 nt4.67□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 LCB2YDR062W 1686 nt4.67□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 LAP2YNL045W 2016 nt4.67□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 YER147C-AYER147C-A 411 nt4.66□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt4.66□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 YJL220WYJL220W 453 nt4.66□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 GAT3YLR013W 426 nt4.66□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 MAC1YMR021C 1254 nt4.66□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 MDG1YNL173C 1101 nt4.66□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 GRS1YBR121C 2004 nt4.66□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 PHO90YJL198W 2646 nt4.66□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 MRE11YMR224C 2079 nt4.65□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 SIP5YMR140W 1470 nt4.65□□□□□ -1.66
CCE1Q03702 YDR417CYDR417C 372 nt4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.1 ms