Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ROM1Q03395 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ROM1Q03395 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 671.8 ms