Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SP4Q02446 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP4Q02446 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP4Q02446 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP4Q02446 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP4Q02446 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP4Q02446 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SP4Q02446 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP4Q02446 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP4Q02446 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP4Q02446 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP4Q02446 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP4Q02446 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP4Q02446 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP4Q02446 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP4Q02446 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP4Q02446 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SP4Q02446 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP4Q02446 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP4Q02446 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP4Q02446 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP4Q02446 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP4Q02446 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP4Q02446 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SP4Q02446 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP4Q02446 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP4Q02446 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP4Q02446 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SP4Q02446 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP4Q02446 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SP4Q02446 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP4Q02446 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP4Q02446 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP4Q02446 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP4Q02446 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP4Q02446 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SP4Q02446 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP4Q02446 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP4Q02446 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP4Q02446 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SP4Q02446 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SP4Q02446 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SP4Q02446 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP4Q02446 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP4Q02446 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP4Q02446 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP4Q02446 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP4Q02446 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP4Q02446 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP4Q02446 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP4Q02446 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP4Q02446 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SP4Q02446 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP4Q02446 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP4Q02446 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP4Q02446 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP4Q02446 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP4Q02446 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP4Q02446 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP4Q02446 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP4Q02446 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SP4Q02446 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SP4Q02446 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SP4Q02446 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SP4Q02446 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SP4Q02446 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SP4Q02446 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SP4Q02446 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SP4Q02446 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP4Q02446 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP4Q02446 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP4Q02446 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP4Q02446 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP4Q02446 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP4Q02446 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SP4Q02446 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SP4Q02446 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SP4Q02446 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SP4Q02446 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SP4Q02446 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SP4Q02446 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SP4Q02446 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SP4Q02446 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SP4Q02446 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP4Q02446 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP4Q02446 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP4Q02446 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP4Q02446 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP4Q02446 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP4Q02446 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP4Q02446 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP4Q02446 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP4Q02446 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SP4Q02446 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SP4Q02446 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SP4Q02446 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SP4Q02446 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SP4Q02446 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SP4Q02446 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SP4Q02446 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms