Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
EXOSC10Q01780 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EXOSC10Q01780 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms