Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAP1Q01518 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CAP1Q01518 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms