Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMP22Q01453 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms