Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MYBPC1Q00872 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MYBPC1Q00872 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MYBPC1Q00872 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms