Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCCQ00597 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FANCCQ00597 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FANCCQ00597 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms