Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX1P83916 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX1P83916 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX1P83916 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX1P83916 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX1P83916 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CBX1P83916 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CBX1P83916 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX1P83916 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX1P83916 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CBX1P83916 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX1P83916 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CBX1P83916 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX1P83916 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX1P83916 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CBX1P83916 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX1P83916 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX1P83916 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX1P83916 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CBX1P83916 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CBX1P83916 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX1P83916 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX1P83916 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX1P83916 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX1P83916 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX1P83916 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX1P83916 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX1P83916 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX1P83916 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX1P83916 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX1P83916 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX1P83916 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX1P83916 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX1P83916 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CBX1P83916 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX1P83916 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX1P83916 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX1P83916 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX1P83916 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX1P83916 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX1P83916 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX1P83916 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX1P83916 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX1P83916 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX1P83916 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX1P83916 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CBX1P83916 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX1P83916 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX1P83916 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX1P83916 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX1P83916 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX1P83916 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX1P83916 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CBX1P83916 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX1P83916 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX1P83916 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX1P83916 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX1P83916 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX1P83916 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX1P83916 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX1P83916 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX1P83916 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX1P83916 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX1P83916 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX1P83916 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CBX1P83916 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX1P83916 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX1P83916 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX1P83916 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX1P83916 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX1P83916 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX1P83916 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CBX1P83916 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX1P83916 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX1P83916 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX1P83916 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX1P83916 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX1P83916 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX1P83916 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX1P83916 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX1P83916 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX1P83916 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX1P83916 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX1P83916 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CBX1P83916 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX1P83916 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX1P83916 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX1P83916 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX1P83916 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX1P83916 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX1P83916 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX1P83916 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CBX1P83916 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX1P83916 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX1P83916 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX1P83916 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX1P83916 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX1P83916 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX1P83916 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CBX1P83916 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms