Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLDN10P78369 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN10P78369 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN10P78369 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms