Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NOMO3P69849 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOMO3P69849 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOMO3P69849 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOMO3P69849 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms