Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VSNL1P62760 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VSNL1P62760 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms