Protein–RNA interactions for Protein: P62277

RPS13, 40S ribosomal protein S13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS13P62277 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS13P62277 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS13P62277 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS13P62277 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS13P62277 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS13P62277 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS13P62277 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS13P62277 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS13P62277 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS13P62277 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS13P62277 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS13P62277 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS13P62277 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS13P62277 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS13P62277 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS13P62277 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS13P62277 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS13P62277 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS13P62277 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS13P62277 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS13P62277 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS13P62277 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS13P62277 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS13P62277 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS13P62277 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS13P62277 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS13P62277 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS13P62277 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS13P62277 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS13P62277 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS13P62277 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS13P62277 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS13P62277 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS13P62277 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS13P62277 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPS13P62277 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPS13P62277 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPS13P62277 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS13P62277 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS13P62277 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS13P62277 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS13P62277 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS13P62277 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS13P62277 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS13P62277 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS13P62277 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS13P62277 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS13P62277 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS13P62277 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS13P62277 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS13P62277 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS13P62277 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS13P62277 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS13P62277 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS13P62277 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS13P62277 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS13P62277 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS13P62277 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS13P62277 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS13P62277 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS13P62277 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS13P62277 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS13P62277 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS13P62277 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS13P62277 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS13P62277 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS13P62277 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS13P62277 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS13P62277 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS13P62277 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS13P62277 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS13P62277 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS13P62277 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS13P62277 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS13P62277 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS13P62277 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS13P62277 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS13P62277 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS13P62277 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS13P62277 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS13P62277 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS13P62277 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS13P62277 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS13P62277 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS13P62277 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS13P62277 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS13P62277 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS13P62277 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS13P62277 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS13P62277 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS13P62277 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS13P62277 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS13P62277 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS13P62277 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS13P62277 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS13P62277 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS13P62277 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS13P62277 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS13P62277 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS13P62277 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms