Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ERVK11-1P61568 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVK11-1P61568 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ERVK11-1P61568 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms