Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTBP60709 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTBP60709 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTBP60709 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTBP60709 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTBP60709 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTBP60709 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ACTBP60709 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTBP60709 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTBP60709 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTBP60709 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ACTBP60709 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTBP60709 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTBP60709 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTBP60709 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ACTBP60709 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTBP60709 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTBP60709 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTBP60709 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTBP60709 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTBP60709 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTBP60709 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTBP60709 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTBP60709 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTBP60709 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTBP60709 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTBP60709 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTBP60709 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTBP60709 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTBP60709 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTBP60709 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTBP60709 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTBP60709 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTBP60709 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTBP60709 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTBP60709 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTBP60709 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTBP60709 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTBP60709 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTBP60709 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTBP60709 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTBP60709 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTBP60709 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTBP60709 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTBP60709 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTBP60709 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTBP60709 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTBP60709 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTBP60709 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTBP60709 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTBP60709 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTBP60709 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTBP60709 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTBP60709 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTBP60709 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTBP60709 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTBP60709 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTBP60709 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTBP60709 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTBP60709 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTBP60709 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTBP60709 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTBP60709 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTBP60709 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTBP60709 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTBP60709 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTBP60709 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTBP60709 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTBP60709 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTBP60709 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTBP60709 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTBP60709 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTBP60709 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTBP60709 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTBP60709 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTBP60709 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTBP60709 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTBP60709 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTBP60709 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTBP60709 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTBP60709 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTBP60709 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTBP60709 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTBP60709 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTBP60709 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTBP60709 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ACTBP60709 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTBP60709 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTBP60709 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTBP60709 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTBP60709 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ACTBP60709 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACTBP60709 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ACTBP60709 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTBP60709 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTBP60709 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTBP60709 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTBP60709 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTBP60709 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ACTBP60709 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms