Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX16P57768 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX16P57768 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX16P57768 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX16P57768 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX16P57768 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX16P57768 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX16P57768 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX16P57768 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX16P57768 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX16P57768 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX16P57768 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX16P57768 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX16P57768 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX16P57768 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX16P57768 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX16P57768 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX16P57768 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX16P57768 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX16P57768 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX16P57768 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX16P57768 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX16P57768 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX16P57768 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX16P57768 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX16P57768 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX16P57768 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX16P57768 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX16P57768 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX16P57768 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX16P57768 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX16P57768 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX16P57768 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX16P57768 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX16P57768 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX16P57768 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX16P57768 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX16P57768 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX16P57768 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX16P57768 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX16P57768 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX16P57768 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX16P57768 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX16P57768 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX16P57768 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX16P57768 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX16P57768 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX16P57768 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX16P57768 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX16P57768 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX16P57768 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX16P57768 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX16P57768 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX16P57768 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX16P57768 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX16P57768 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX16P57768 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX16P57768 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX16P57768 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX16P57768 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX16P57768 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX16P57768 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX16P57768 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX16P57768 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX16P57768 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX16P57768 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX16P57768 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX16P57768 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX16P57768 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX16P57768 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX16P57768 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX16P57768 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX16P57768 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX16P57768 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX16P57768 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX16P57768 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX16P57768 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX16P57768 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX16P57768 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX16P57768 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX16P57768 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX16P57768 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX16P57768 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX16P57768 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX16P57768 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX16P57768 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX16P57768 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX16P57768 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX16P57768 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX16P57768 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX16P57768 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX16P57768 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX16P57768 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX16P57768 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX16P57768 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX16P57768 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX16P57768 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX16P57768 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX16P57768 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX16P57768 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms