Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRG3P56975 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRG3P56975 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NRG3P56975 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRG3P56975 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRG3P56975 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRG3P56975 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRG3P56975 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRG3P56975 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRG3P56975 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NRG3P56975 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRG3P56975 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRG3P56975 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRG3P56975 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRG3P56975 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRG3P56975 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRG3P56975 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRG3P56975 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRG3P56975 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRG3P56975 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRG3P56975 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRG3P56975 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRG3P56975 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRG3P56975 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NRG3P56975 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRG3P56975 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRG3P56975 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRG3P56975 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRG3P56975 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRG3P56975 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRG3P56975 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRG3P56975 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRG3P56975 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRG3P56975 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRG3P56975 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRG3P56975 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRG3P56975 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRG3P56975 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRG3P56975 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRG3P56975 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRG3P56975 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRG3P56975 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRG3P56975 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NRG3P56975 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRG3P56975 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NRG3P56975 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRG3P56975 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRG3P56975 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRG3P56975 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NRG3P56975 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NRG3P56975 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NRG3P56975 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRG3P56975 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NRG3P56975 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRG3P56975 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NRG3P56975 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRG3P56975 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRG3P56975 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRG3P56975 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRG3P56975 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NRG3P56975 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms