Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STX17P56962 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STX17P56962 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX17P56962 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX17P56962 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX17P56962 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX17P56962 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX17P56962 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
STX17P56962 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX17P56962 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX17P56962 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX17P56962 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX17P56962 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX17P56962 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX17P56962 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX17P56962 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX17P56962 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX17P56962 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX17P56962 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX17P56962 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX17P56962 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX17P56962 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX17P56962 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX17P56962 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX17P56962 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX17P56962 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX17P56962 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX17P56962 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX17P56962 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX17P56962 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
STX17P56962 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX17P56962 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX17P56962 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX17P56962 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STX17P56962 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STX17P56962 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STX17P56962 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STX17P56962 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STX17P56962 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX17P56962 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX17P56962 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX17P56962 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX17P56962 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX17P56962 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX17P56962 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX17P56962 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX17P56962 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX17P56962 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STX17P56962 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STX17P56962 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STX17P56962 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STX17P56962 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
STX17P56962 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
STX17P56962 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
STX17P56962 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX17P56962 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX17P56962 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX17P56962 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STX17P56962 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX17P56962 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX17P56962 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX17P56962 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX17P56962 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX17P56962 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX17P56962 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX17P56962 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STX17P56962 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX17P56962 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX17P56962 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX17P56962 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX17P56962 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STX17P56962 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX17P56962 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX17P56962 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STX17P56962 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX17P56962 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX17P56962 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX17P56962 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX17P56962 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STX17P56962 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STX17P56962 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX17P56962 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX17P56962 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX17P56962 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX17P56962 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
STX17P56962 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
STX17P56962 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX17P56962 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX17P56962 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX17P56962 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STX17P56962 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
STX17P56962 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX17P56962 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX17P56962 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX17P56962 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX17P56962 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX17P56962 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX17P56962 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STX17P56962 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX17P56962 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms