Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EIF3BP55884 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EIF3BP55884 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms