Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH15P55291 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH15P55291 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH15P55291 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH15P55291 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH15P55291 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH15P55291 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH15P55291 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH15P55291 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH15P55291 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH15P55291 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH15P55291 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH15P55291 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH15P55291 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH15P55291 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH15P55291 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH15P55291 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH15P55291 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH15P55291 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH15P55291 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH15P55291 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH15P55291 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH15P55291 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH15P55291 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH15P55291 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH15P55291 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH15P55291 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDH15P55291 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH15P55291 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH15P55291 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH15P55291 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH15P55291 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH15P55291 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH15P55291 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH15P55291 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDH15P55291 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH15P55291 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH15P55291 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH15P55291 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH15P55291 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH15P55291 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH15P55291 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH15P55291 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDH15P55291 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH15P55291 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH15P55291 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH15P55291 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH15P55291 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH15P55291 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH15P55291 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH15P55291 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH15P55291 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH15P55291 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH15P55291 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH15P55291 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDH15P55291 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH15P55291 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH15P55291 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH15P55291 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH15P55291 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH15P55291 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH15P55291 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH15P55291 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH15P55291 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH15P55291 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH15P55291 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH15P55291 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH15P55291 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH15P55291 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH15P55291 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDH15P55291 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH15P55291 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH15P55291 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH15P55291 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH15P55291 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH15P55291 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH15P55291 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH15P55291 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH15P55291 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDH15P55291 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH15P55291 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH15P55291 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH15P55291 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH15P55291 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH15P55291 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH15P55291 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH15P55291 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDH15P55291 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH15P55291 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH15P55291 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH15P55291 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH15P55291 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH15P55291 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH15P55291 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH15P55291 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH15P55291 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH15P55291 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH15P55291 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH15P55291 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH15P55291 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms