Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASP7P55210 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASP7P55210 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CASP7P55210 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASP7P55210 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASP7P55210 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP7P55210 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP7P55210 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP7P55210 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP7P55210 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP7P55210 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP7P55210 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP7P55210 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP7P55210 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP7P55210 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP7P55210 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CASP7P55210 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASP7P55210 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASP7P55210 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASP7P55210 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASP7P55210 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASP7P55210 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASP7P55210 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASP7P55210 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASP7P55210 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASP7P55210 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CASP7P55210 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASP7P55210 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASP7P55210 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASP7P55210 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASP7P55210 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASP7P55210 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASP7P55210 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASP7P55210 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP7P55210 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP7P55210 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP7P55210 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP7P55210 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP7P55210 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP7P55210 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP7P55210 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP7P55210 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASP7P55210 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CASP7P55210 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CASP7P55210 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CASP7P55210 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CASP7P55210 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CASP7P55210 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CASP7P55210 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CASP7P55210 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP7P55210 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP7P55210 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP7P55210 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP7P55210 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP7P55210 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP7P55210 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASP7P55210 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP7P55210 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP7P55210 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP7P55210 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP7P55210 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP7P55210 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASP7P55210 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP7P55210 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP7P55210 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP7P55210 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP7P55210 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP7P55210 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP7P55210 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP7P55210 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP7P55210 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASP7P55210 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASP7P55210 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASP7P55210 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASP7P55210 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASP7P55210 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASP7P55210 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP7P55210 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP7P55210 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP7P55210 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP7P55210 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP7P55210 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP7P55210 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP7P55210 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP7P55210 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASP7P55210 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASP7P55210 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASP7P55210 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASP7P55210 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASP7P55210 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASP7P55210 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASP7P55210 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
CASP7P55210 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP7P55210 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP7P55210 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP7P55210 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP7P55210 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP7P55210 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP7P55210 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASP7P55210 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms