Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR1H2P55055 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1H2P55055 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms