Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NAPAP54920 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NAPAP54920 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NAPAP54920 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NAPAP54920 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NAPAP54920 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAPAP54920 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAPAP54920 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAPAP54920 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAPAP54920 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAPAP54920 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAPAP54920 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NAPAP54920 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NAPAP54920 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NAPAP54920 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NAPAP54920 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NAPAP54920 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NAPAP54920 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NAPAP54920 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NAPAP54920 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NAPAP54920 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NAPAP54920 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NAPAP54920 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NAPAP54920 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NAPAP54920 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NAPAP54920 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAPAP54920 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAPAP54920 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAPAP54920 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAPAP54920 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAPAP54920 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAPAP54920 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAPAP54920 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAPAP54920 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAPAP54920 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NAPAP54920 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NAPAP54920 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NAPAP54920 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NAPAP54920 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NAPAP54920 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NAPAP54920 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NAPAP54920 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NAPAP54920 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NAPAP54920 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NAPAP54920 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAPAP54920 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAPAP54920 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAPAP54920 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAPAP54920 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAPAP54920 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAPAP54920 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAPAP54920 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAPAP54920 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAPAP54920 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAPAP54920 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAPAP54920 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAPAP54920 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NAPAP54920 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAPAP54920 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAPAP54920 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAPAP54920 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAPAP54920 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAPAP54920 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAPAP54920 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAPAP54920 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAPAP54920 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAPAP54920 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NAPAP54920 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NAPAP54920 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NAPAP54920 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NAPAP54920 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NAPAP54920 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NAPAP54920 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NAPAP54920 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NAPAP54920 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NAPAP54920 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NAPAP54920 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NAPAP54920 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NAPAP54920 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NAPAP54920 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NAPAP54920 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NAPAP54920 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NAPAP54920 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NAPAP54920 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NAPAP54920 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAPAP54920 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAPAP54920 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAPAP54920 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAPAP54920 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAPAP54920 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAPAP54920 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAPAP54920 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAPAP54920 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NAPAP54920 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAPAP54920 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAPAP54920 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAPAP54920 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAPAP54920 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAPAP54920 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NAPAP54920 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms