Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RARSP54136 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RARSP54136 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RARSP54136 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RARSP54136 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RARSP54136 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RARSP54136 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RARSP54136 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RARSP54136 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RARSP54136 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RARSP54136 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RARSP54136 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RARSP54136 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RARSP54136 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RARSP54136 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RARSP54136 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RARSP54136 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RARSP54136 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RARSP54136 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RARSP54136 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RARSP54136 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RARSP54136 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RARSP54136 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RARSP54136 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RARSP54136 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RARSP54136 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RARSP54136 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RARSP54136 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RARSP54136 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RARSP54136 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RARSP54136 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RARSP54136 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RARSP54136 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RARSP54136 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RARSP54136 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RARSP54136 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RARSP54136 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RARSP54136 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RARSP54136 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RARSP54136 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RARSP54136 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RARSP54136 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RARSP54136 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RARSP54136 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RARSP54136 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RARSP54136 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RARSP54136 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RARSP54136 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RARSP54136 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RARSP54136 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RARSP54136 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RARSP54136 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RARSP54136 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RARSP54136 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RARSP54136 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RARSP54136 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RARSP54136 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RARSP54136 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RARSP54136 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RARSP54136 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RARSP54136 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RARSP54136 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RARSP54136 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RARSP54136 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RARSP54136 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RARSP54136 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RARSP54136 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RARSP54136 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RARSP54136 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RARSP54136 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RARSP54136 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RARSP54136 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RARSP54136 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RARSP54136 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RARSP54136 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RARSP54136 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RARSP54136 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RARSP54136 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RARSP54136 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RARSP54136 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RARSP54136 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RARSP54136 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RARSP54136 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RARSP54136 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RARSP54136 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RARSP54136 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RARSP54136 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RARSP54136 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RARSP54136 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RARSP54136 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RARSP54136 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RARSP54136 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RARSP54136 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RARSP54136 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RARSP54136 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RARSP54136 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RARSP54136 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RARSP54136 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RARSP54136 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RARSP54136 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms