Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CRISP1P54107 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CRISP1P54107 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CRISP1P54107 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRISP1P54107 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRISP1P54107 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRISP1P54107 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms