Protein–RNA interactions for Protein: P53947

YNL058C, Vacuolar membrane protein YNL058C, yeastyeast

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL058CP53947 HSP32YPL280W 714 nt5.38□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 SDA1YGR245C 2304 nt5.38□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 HFI1YPL254W 1467 nt5.38□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 SYG1YIL047C 2709 nt5.38□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 SSY5YJL156C 2100 nt5.38□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 NOC4YPR144C 1659 nt5.37□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 FRE7YOL152W 1863 nt5.37□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 GIR2YDR152W 798 nt5.37□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 CAD1YDR423C 1230 nt5.37□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 YEL028WYEL028W 462 nt5.37□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 MRF1YGL143C 1242 nt5.37□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 SED5YLR026C 1023 nt5.37□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 MRPL22YNL177C 930 nt5.37□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 YOL050CYOL050C 321 nt5.37□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 RRP40YOL142W 723 nt5.37□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 GPI2YPL076W 843 nt5.37□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 KIP2YPL155C 2121 nt5.37□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 WTM1YOR230W 1314 nt5.37□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 HES1YOR237W 1305 nt5.37□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 ECM32YER176W 3366 nt5.37□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 SIP5YMR140W 1470 nt5.37□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 RAM1YDL090C 1296 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 GCS1YDL226C 1059 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 ATP12YJL180C 978 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 MTW1YAL034W-A 870 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 PRS1YKL181W 1284 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 YBL029WYBL029W 1131 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 SPG4YMR107W 348 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 LST8YNL006W 912 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 RPS19BYNL302C 435 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 ULA1YPL003W 1389 nt5.36□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 TPO2YGR138C 1845 nt5.35□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 MKS1YNL076W 1755 nt5.35□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 MIF2YKL089W 1650 nt5.35□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 SUR2YDR297W 1050 nt5.35□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 CBP4YGR174C 513 nt5.35□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 YLR402WYLR402W 192 nt5.35□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 YDC1YPL087W 954 nt5.35□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 ADE6YGR061C 4077 nt5.35□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 NFI1YOR156C 2181 nt5.35□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 IFM1YOL023W 2031 nt5.35□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 QDR1YIL120W 1692 nt5.34□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 RPT4YOR259C 1314 nt5.34□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 ROT1YMR200W 771 nt5.34□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 ROX3YBL093C 663 nt5.34□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 VAM3YOR106W 852 nt5.34□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 ARR3YPR201W 1215 nt5.34□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 ACC1YNR016C 6702 nt5.34□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 ACF2YLR144C 2340 nt5.34□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 NUP116YMR047C 3342 nt5.33□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 MMR1YLR190W 1476 nt5.33□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 VHS1YDR247W 1386 nt5.33□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 CTR3YLR411W 726 nt5.33□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 PPG1YNR032W 1107 nt5.33□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.33□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 ISA2YPR067W 558 nt5.33□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.33□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 KTR3YBR205W 1215 nt5.33□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 NNK1YKL171W 2787 nt5.33□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 PRM7YDL039C 2097 nt5.32□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 GCV1YDR019C 1203 nt5.32□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 RML2YEL050C 1182 nt5.32□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 ACT1YFL039C 1128 nt5.32□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 DUO1YGL061C 744 nt5.32□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 SPO74YGL170C 1242 nt5.32□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 SKI8YGL213C 1194 nt5.32□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 SCO1YBR037C 888 nt5.32□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 MSE1YOL033W 1611 nt5.32□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 STB2YMR053C 2553 nt5.32□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 DHH1YDL160C 1521 nt5.32□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 ARO9YHR137W 1542 nt5.32□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 ALD3YMR169C 1521 nt5.32□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 ALD2YMR170C 1521 nt5.32□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 DAL81YIR023W 2913 nt5.31□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 YTA6YPL074W 2265 nt5.31□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 YER133W-AYER133W-A 342 nt5.31□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 YFR035CYFR035C 345 nt5.31□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 YGR016WYGR016W 573 nt5.31□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 COS9YKL219W 1224 nt5.31□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 TFS1YLR178C 660 nt5.31□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt5.31□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 CSL4YNL232W 879 nt5.31□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 YPR109WYPR109W 885 nt5.31□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 MPH2YDL247W 1830 nt5.31□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 YDL119CYDL119C 924 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 YDL121CYDL121C 450 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 YJL215CYJL215C 360 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 MRP17YKL003C 396 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 ARC19YKL013C 516 nt5.3□□□□□ -1.56
YNL058CP53947 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 78.6 ms