Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MVDP53602 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MVDP53602 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MVDP53602 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MVDP53602 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MVDP53602 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MVDP53602 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MVDP53602 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MVDP53602 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MVDP53602 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MVDP53602 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MVDP53602 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MVDP53602 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MVDP53602 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MVDP53602 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MVDP53602 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MVDP53602 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MVDP53602 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MVDP53602 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MVDP53602 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MVDP53602 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVDP53602 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MVDP53602 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVDP53602 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVDP53602 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVDP53602 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVDP53602 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVDP53602 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MVDP53602 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVDP53602 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVDP53602 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVDP53602 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MVDP53602 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MVDP53602 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MVDP53602 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MVDP53602 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MVDP53602 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MVDP53602 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MVDP53602 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MVDP53602 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MVDP53602 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MVDP53602 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MVDP53602 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MVDP53602 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MVDP53602 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MVDP53602 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MVDP53602 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVDP53602 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVDP53602 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVDP53602 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVDP53602 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVDP53602 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MVDP53602 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVDP53602 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVDP53602 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MVDP53602 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MVDP53602 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVDP53602 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVDP53602 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVDP53602 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVDP53602 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVDP53602 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVDP53602 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVDP53602 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVDP53602 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVDP53602 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVDP53602 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVDP53602 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVDP53602 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVDP53602 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MVDP53602 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVDP53602 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVDP53602 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVDP53602 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVDP53602 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVDP53602 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVDP53602 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVDP53602 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVDP53602 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVDP53602 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVDP53602 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVDP53602 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVDP53602 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MVDP53602 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MVDP53602 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MVDP53602 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MVDP53602 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MVDP53602 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MVDP53602 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MVDP53602 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MVDP53602 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MVDP53602 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MVDP53602 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MVDP53602 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MVDP53602 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MVDP53602 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MVDP53602 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MVDP53602 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MVDP53602 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MVDP53602 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms