Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IDH3AP50213 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IDH3AP50213 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IDH3AP50213 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms