Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPFP49454 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPFP49454 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPFP49454 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPFP49454 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPFP49454 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPFP49454 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPFP49454 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPFP49454 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPFP49454 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPFP49454 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPFP49454 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPFP49454 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPFP49454 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPFP49454 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPFP49454 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPFP49454 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPFP49454 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPFP49454 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPFP49454 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPFP49454 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPFP49454 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPFP49454 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPFP49454 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPFP49454 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPFP49454 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPFP49454 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPFP49454 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPFP49454 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPFP49454 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPFP49454 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPFP49454 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPFP49454 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPFP49454 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPFP49454 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPFP49454 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPFP49454 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPFP49454 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPFP49454 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPFP49454 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPFP49454 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPFP49454 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPFP49454 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPFP49454 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPFP49454 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPFP49454 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPFP49454 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPFP49454 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPFP49454 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPFP49454 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPFP49454 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPFP49454 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPFP49454 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPFP49454 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPFP49454 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPFP49454 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPFP49454 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPFP49454 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPFP49454 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPFP49454 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPFP49454 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPFP49454 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPFP49454 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPFP49454 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPFP49454 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPFP49454 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPFP49454 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPFP49454 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPFP49454 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPFP49454 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPFP49454 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPFP49454 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPFP49454 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPFP49454 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPFP49454 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPFP49454 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPFP49454 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPFP49454 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPFP49454 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPFP49454 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPFP49454 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPFP49454 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPFP49454 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPFP49454 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPFP49454 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPFP49454 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPFP49454 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPFP49454 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPFP49454 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPFP49454 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPFP49454 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPFP49454 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPFP49454 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPFP49454 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPFP49454 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CENPFP49454 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CENPFP49454 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CENPFP49454 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPFP49454 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CENPFP49454 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms