Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRIP1P48552 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NRIP1P48552 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms