Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSSP48449 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSSP48449 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSSP48449 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSSP48449 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSSP48449 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSSP48449 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSSP48449 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSSP48449 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSSP48449 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSSP48449 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSSP48449 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSSP48449 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSSP48449 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSSP48449 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LSSP48449 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSSP48449 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LSSP48449 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSSP48449 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSSP48449 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSSP48449 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSSP48449 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSSP48449 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSSP48449 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSSP48449 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSSP48449 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSSP48449 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSSP48449 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSSP48449 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSSP48449 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSSP48449 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSSP48449 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSSP48449 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSSP48449 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSSP48449 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSSP48449 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSSP48449 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSSP48449 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSSP48449 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSSP48449 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSSP48449 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSSP48449 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LSSP48449 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSSP48449 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSSP48449 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSSP48449 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSSP48449 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSSP48449 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LSSP48449 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSSP48449 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSSP48449 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LSSP48449 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSSP48449 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSSP48449 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSSP48449 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSSP48449 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSSP48449 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSSP48449 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSSP48449 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSSP48449 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSSP48449 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSSP48449 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSSP48449 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSSP48449 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSSP48449 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSSP48449 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSSP48449 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSSP48449 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSSP48449 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSSP48449 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSSP48449 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSSP48449 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSSP48449 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSSP48449 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSSP48449 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSSP48449 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSSP48449 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSSP48449 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSSP48449 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSSP48449 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LSSP48449 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LSSP48449 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LSSP48449 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSSP48449 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSSP48449 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSSP48449 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSSP48449 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSSP48449 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSSP48449 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LSSP48449 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSSP48449 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSSP48449 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSSP48449 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSSP48449 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LSSP48449 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSSP48449 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSSP48449 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSSP48449 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSSP48449 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSSP48449 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms