Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA8P48165 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA8P48165 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA8P48165 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA8P48165 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA8P48165 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA8P48165 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA8P48165 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA8P48165 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJA8P48165 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJA8P48165 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJA8P48165 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJA8P48165 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA8P48165 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA8P48165 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA8P48165 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA8P48165 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA8P48165 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA8P48165 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJA8P48165 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA8P48165 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA8P48165 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA8P48165 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA8P48165 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA8P48165 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GJA8P48165 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA8P48165 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA8P48165 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA8P48165 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA8P48165 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA8P48165 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJA8P48165 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA8P48165 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA8P48165 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA8P48165 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA8P48165 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA8P48165 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA8P48165 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA8P48165 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA8P48165 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA8P48165 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJA8P48165 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJA8P48165 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJA8P48165 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA8P48165 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA8P48165 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA8P48165 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA8P48165 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA8P48165 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA8P48165 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA8P48165 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA8P48165 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA8P48165 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA8P48165 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA8P48165 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA8P48165 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA8P48165 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA8P48165 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA8P48165 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA8P48165 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA8P48165 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA8P48165 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA8P48165 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA8P48165 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA8P48165 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA8P48165 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA8P48165 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA8P48165 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA8P48165 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA8P48165 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA8P48165 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA8P48165 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA8P48165 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA8P48165 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA8P48165 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA8P48165 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA8P48165 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA8P48165 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA8P48165 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA8P48165 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA8P48165 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA8P48165 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA8P48165 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA8P48165 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA8P48165 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA8P48165 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA8P48165 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA8P48165 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA8P48165 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA8P48165 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA8P48165 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA8P48165 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA8P48165 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA8P48165 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA8P48165 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA8P48165 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA8P48165 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA8P48165 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
GJA8P48165 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA8P48165 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms