Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC6A11P48066 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC6A11P48066 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms