Protein–RNA interactions for Protein: P46777

RPL5, 60S ribosomal protein L5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL5P46777 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL5P46777 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL5P46777 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL5P46777 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL5P46777 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL5P46777 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL5P46777 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL5P46777 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL5P46777 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL5P46777 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL5P46777 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL5P46777 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL5P46777 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL5P46777 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL5P46777 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL5P46777 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL5P46777 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL5P46777 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL5P46777 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL5P46777 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL5P46777 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL5P46777 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL5P46777 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL5P46777 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL5P46777 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL5P46777 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL5P46777 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL5P46777 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL5P46777 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL5P46777 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL5P46777 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL5P46777 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL5P46777 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL5P46777 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL5P46777 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL5P46777 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL5P46777 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL5P46777 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL5P46777 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL5P46777 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL5P46777 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL5P46777 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL5P46777 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL5P46777 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL5P46777 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL5P46777 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL5P46777 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL5P46777 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL5P46777 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL5P46777 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL5P46777 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPL5P46777 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPL5P46777 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL5P46777 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL5P46777 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL5P46777 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL5P46777 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL5P46777 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL5P46777 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL5P46777 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL5P46777 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL5P46777 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL5P46777 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL5P46777 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL5P46777 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL5P46777 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL5P46777 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL5P46777 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL5P46777 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL5P46777 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL5P46777 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL5P46777 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL5P46777 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL5P46777 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL5P46777 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL5P46777 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL5P46777 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL5P46777 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL5P46777 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL5P46777 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL5P46777 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL5P46777 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL5P46777 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL5P46777 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL5P46777 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL5P46777 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL5P46777 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL5P46777 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL5P46777 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL5P46777 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL5P46777 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL5P46777 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL5P46777 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL5P46777 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL5P46777 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL5P46777 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL5P46777 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL5P46777 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL5P46777 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL5P46777 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms