Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCC3P46736 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BRCC3P46736 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRCC3P46736 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms