Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSKP43235 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSKP43235 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSKP43235 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSKP43235 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSKP43235 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSKP43235 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSKP43235 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSKP43235 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSKP43235 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSKP43235 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSKP43235 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSKP43235 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSKP43235 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSKP43235 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSKP43235 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSKP43235 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSKP43235 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSKP43235 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSKP43235 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSKP43235 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSKP43235 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSKP43235 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSKP43235 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSKP43235 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSKP43235 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSKP43235 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSKP43235 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSKP43235 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSKP43235 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSKP43235 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSKP43235 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSKP43235 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSKP43235 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSKP43235 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSKP43235 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSKP43235 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSKP43235 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSKP43235 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSKP43235 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSKP43235 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSKP43235 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSKP43235 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSKP43235 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSKP43235 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTSKP43235 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSKP43235 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSKP43235 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSKP43235 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSKP43235 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSKP43235 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSKP43235 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSKP43235 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSKP43235 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSKP43235 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSKP43235 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSKP43235 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSKP43235 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSKP43235 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSKP43235 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSKP43235 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSKP43235 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSKP43235 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSKP43235 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSKP43235 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSKP43235 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSKP43235 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSKP43235 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSKP43235 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSKP43235 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSKP43235 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSKP43235 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSKP43235 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSKP43235 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSKP43235 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSKP43235 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSKP43235 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSKP43235 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSKP43235 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSKP43235 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSKP43235 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 618 ms