Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC1A4P43007 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC1A4P43007 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.7 ms