Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TMPOP42166 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMPOP42166 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMPOP42166 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMPOP42166 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMPOP42166 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMPOP42166 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TMPOP42166 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMPOP42166 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMPOP42166 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMPOP42166 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMPOP42166 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMPOP42166 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMPOP42166 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMPOP42166 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMPOP42166 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMPOP42166 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMPOP42166 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMPOP42166 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TMPOP42166 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMPOP42166 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMPOP42166 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMPOP42166 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMPOP42166 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMPOP42166 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMPOP42166 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMPOP42166 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMPOP42166 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMPOP42166 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TMPOP42166 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMPOP42166 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMPOP42166 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMPOP42166 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMPOP42166 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMPOP42166 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMPOP42166 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMPOP42166 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMPOP42166 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMPOP42166 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMPOP42166 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMPOP42166 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMPOP42166 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMPOP42166 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMPOP42166 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMPOP42166 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMPOP42166 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMPOP42166 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMPOP42166 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.07■■■□□ 2.41
TMPOP42166 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMPOP42166 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMPOP42166 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMPOP42166 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMPOP42166 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMPOP42166 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMPOP42166 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMPOP42166 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMPOP42166 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMPOP42166 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMPOP42166 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMPOP42166 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMPOP42166 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMPOP42166 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMPOP42166 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMPOP42166 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMPOP42166 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMPOP42166 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TMPOP42166 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMPOP42166 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMPOP42166 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMPOP42166 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMPOP42166 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMPOP42166 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMPOP42166 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMPOP42166 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMPOP42166 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMPOP42166 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMPOP42166 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMPOP42166 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMPOP42166 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMPOP42166 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMPOP42166 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMPOP42166 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMPOP42166 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMPOP42166 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMPOP42166 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TMPOP42166 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMPOP42166 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMPOP42166 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMPOP42166 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMPOP42166 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TMPOP42166 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMPOP42166 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMPOP42166 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMPOP42166 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMPOP42166 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMPOP42166 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TMPOP42166 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TMPOP42166 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TMPOP42166 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
TMPOP42166 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms